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中关村水木医疗科技服务集团成立于2017 年,总部位于北京亦庄经济技术开发区。致力于加快推进创新医疗器械产品注册上市进程,解决创新医疗器械企业产业化“最后一公里”的难题。 集团是中国医疗器械行业协会临床试验分会理事长单位、中国医学装备协会应用评价分会常务副会长单位以及北京药学会医疗器械专委会主委单位。

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寻找“离群值”—统计学在体外诊断中的应用(二)

2022-05-13 18:51:35来源 | 网络


上一篇提到抽样,例如体外诊断试剂研发流程中的关键一步——中试阶段,在GMP条件下生产出3批产品,进行产品分析性能评价、临床性能评价、稳定性研究、参考区间或阳性判断值确定、注册检验等工作,这里面就涉及到抽样,从生产出的产品中随机抽取出一定数量,做实验,获得一系列数据,通过对这些数据进行分析处理,最后获得产品的特征参数。


【这一篇我们重点关注数据离群值的判断和处理。】


实验获得的数据,我们不能不管三七二十一,直接上来就计算均值、标准差、偏差。大多数的统计量,如均值、标准差、相关系数等,以及基于这些统计量的分析,均对离群值高度敏感。关注离群值,就是关注数据质量。如图1所示,左边是不去离群值的回归分析,右边是去掉离群值后的回归分析,可以看出回归线差别巨大。如果统计学上认为应该舍弃的数据留用了,势必会降低后续分析的可靠性。相反,本应该留用的数据被舍弃,虽然精密度提高,但却夸大了分析结果的可靠性,从而增加风险。

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图1 离群值剔除和不剔除情况下的回归线


⑴ 什么是离群值


在一组平行测定中,若有个别数据离开其他数据较远,则把此数据视为可疑,即离群值(outlier)。

离群值出现会有两种情形一种出现在数据的单侧,即都为“鹤立鸡群”的高值,或都为“拖后腿”的低值;第二种是出现在双侧,两边都有“不合群”的,即既有高值,也有低值。

离群值产生有两种来源,一是技术错误造成的,即样品错误、测试时的操作错误、仪器故障、计算错误、录入测试结果时的简单书写错误等造成的,这样的离群值可以直接剔除,或剔除后再做实验补数据;第二种来源是不能用技术错误解释的,产生于试验条件、试验方法等因素的偶然偏离,这时就要进行统计处理来决定离群值是保留还是剔除。离群值的取舍对分析结果会产生很大影响,必须谨慎对待,在离群值产生的原因不明之前,不应简单决定其取舍。

在做离群值检验时,要预先规定检出离群值个数的上限,若检出的离群值个数超过了这个上限时,对此样本应做慎重的研究和处理。


⑵ 离群值的几种常见检验方法


在统计学上检验离群值之前,建议先做散点图,这样通过散点图可以一目了然、直观地判断数据情况。如图二所示,离群点是孤立的一个或几个数据点,远离数据集中其他数据点。

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图2 绘制散点图


然后,我们再用统计学方法计算是否是离群值。本篇我们重点关注正态样本(事实上除去正态分布,还有重尾分布、偏态分布等类型,这些分布类型出现得较少,另外也比较复杂,因此我们可以不用重点关注)。设有一组正态样本的观测值,按其大小顺序排列为x1,x2,x3,……,xn。其中最小值 x或最大值 xn 为离群值 (xout)。对于离群值的统计检验,大都是建立在被检测的总体服从正态分布。基于此,在给定的检出水平α (通常取值为0.05) 或显著水平 α* (通常取值为0.01) 和样本容量 n 条件下,可查表获得临界值,再通过计算统计量后与临界值比较,若统计量大于临界值就判为异常。临界值表通常给出的是置信度 P,对双侧检验而言,P = 1 − α/2;对单侧检验而言,P = 1 − α


(一)标准差已知情况

采用奈尔(Nair)检验法(样本量3 ≤ n ≤ 100),根据下式计算统计量Rn

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σ是已知的总体标准差。根据检出水平α 和样本容量查奈尔检验的临界值表值RP(n),若Rn > RP(n),判定为离群值,否则未发现离群值。


(二)标准差未知情况(限定离群值数量为1时)

更多情况下,数据的标准差是未知的,此时可采用的检验离群值的方法较多,本篇仅仅介绍常用的格拉布斯(Grubbs)检验法和狄克逊( Dixon )检验法。


1、 格拉布斯(Grubbs)检验法

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2、狄克逊( Dixon )检验法


此法由Dixon在1950 年提出,它的原理是通过离群值与临近值的差值与极差的比值,这一统计量rij 来判断是否存在离群值。由于样本容量大小的不同会影响此方法的准确度,因此根据样本容量的不同,统计量的计算公式不同,具体见下表。

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判断离群值是最大值还是最小值,再根据样本容量n 代入对应的统计量计算公式,求出统计值 rij (或r 'ij)。确定检出水平α,查狄克逊检验的临界值表值 DP(n)。当 rij 或r 'ij > DP(n),判定为离群值,否则未发现离群值。


3、 t 检验法

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(三)标准差未知情况(离群值数量大于1 时)


当限定检出离群值的个数大于1时,可使用偏度-峰度检验法或狄克逊检验法的重复使用方法。


1、偏度-峰度检验法


偏度检验法适用于离群值出现在单侧的情形。

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式中样本从小到大排列后的第 i 个数据称之为xi。确定检出水平α,查偏度检验的临界值表值bP(n),当bs > bP(n),判定为离群值,否则未发现离群值。当存在有多个离群值时,先选择最内侧的离群值进行检验。例如,当存在有两个上侧离群值 xn、xn−1,暂时去除 xn,测量次数减1,检验 xn−1 是否为离群值。若不为离群值,测量次数为n,再检测xn 是否为离群值。若xn−1 为离群值,xn自然也就舍弃了。


峰度检验法适用于双侧情形确定检出水平 α,查峰度检验的临界值表值 P’b (n)。当 bk > P’b (n),判定离均值 最远的值为离群值,去除离群值后,重复峰度检验法检验是否仍然存在离群值,否则未发现离群值。

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2、 格拉布斯(Grubbs)检验法

原理同上。


3、狄克逊( Dixon )检验法

原理同上。



(四)组间数据等精度检验

 

以上的方法主要针对的是组内数据的检验。对于组间数据,可用柯克伦(Cochran)进行等精度检验,判断数据组间是否有显著性差异,然后再决定是否予以剔除。举一个例子,国家标准物质的定值有几种方法,其中一种方法是可由多个实验室合作定值。合作实验室的数目或独立定值组数应符合统计学的要求(当采用同一种方法时,独立定值组数一般不少于8个,当采用多种方法时,一般不少于6个)。当各个实验室的数据收集上来时,我们要对实验室间数据进行等精度检验。对于不等精度的数据,实验室根据具体情况进行剔除或采用不等精度加权方式处理。


给定p个由相同的n次重复测试结果计算的标准差si,柯克伦检验统计量C定义为

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其中,smax是这组标准差中的最大值。如果C大于临界值,则视为统计离群值。


⑶ 离群值检验的示例


例1:

对同一个样品进行10 次重复测试,将得到的数据按从小到大的顺序排列,91,96,99,101,104,108,111,114,119,138。检验是否存在上侧离群值。


已经检验出该数据服从正态分布。

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方法一 格拉布斯法:

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确定检出水平α = 0.05,查表得到G0.95(10) = 2.176,因为G10 > G0.95(10),所以判定138 为上侧的离群值。


方法二 狄克逊法

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确定检出水平α = 0.05,查表得到D0.95(10) =0.477,因为 r11< D0.95(10),所以不能判定 138 为上侧的离群值。


不同的离群值检验方法可能会有不同的结果。本例中,狄克逊法通过极差比来判断是否存在离群值,当数据本身较为分散,极差比反映离群值的灵敏度就可能会下降,可能存在以假当真的情况。



例2:


6家实验室对Apo A-1候选标物进行协作定值,定值数据见表2。


表2 协作定值测量结果

单位:g/L

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对测量结果进行等精度柯克伦(Cochran)检验,smax=0.016


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查临界值表,C(0.05,6,6)=0.4184,C< C(0.05,6,6),表明各实验室间数据为等精度。



【上期干货】


认识统计学对体外诊断的重要性—统计学在体外诊断中的应用(一)